Ngày mới thành lập đội ngũ cán bộ chỉ mấy chục người, cơ sở vật chất nghèo nàn, lớp học tranh tre, nứa lá, trang thiết bị phục vụ dạy/học thô sơ. Phân hiệu Đại học Y khoa Thái Bình thành lập đúng thời điểm cuộc chiến tranh phá hoại của Đế quốc Mỹ đang diễn ra ác liệt, Trường phải sơ tán về các xã Đông Hải, An Vinh (Quỳnh Phụ). Năm 1972 tiếp tục sơ tán về các xã Minh Lãng, Hiệp Hòa, Tân Hòa (Vũ Thư). Cùng năm đó, cơ sở của Trường bị bom Mỹ phá hủy, cán bộ và nhiều sinh viên đã anh dũng hy sinh ngay tại sân trường. Chiến tranh qua đi lại đến thời kỳ bao cấp với bao khó khăn chồng chất. Năm 1988, Trường có quyết định hợp nhất với Trường Cao đẳng Y tế Nam Định; năm 1992 lại có quyết định chia tách. Đã có lúc tưởng chừng Trường không thể tồn tại... Những khó khăn vất vả một thời chắc hẳn còn in đậm trong tâm trí của nhiều thế hệ thầy và trò Nhà trường. 
       Vượt qua nhiều khó khăn thử thách, Trường đã làm nên những điều kỳ diệu, phi thường. Trong mọi điều kiện, hoàn cảnh, công tác đào tạo vẫn luôn được duy trì, đảm bảo. Theo tiếng gọi của Tổ quốc, nhiều thế hệ thầy trò Nhà trường đã nhập ngũ, ra chiến trường, phục vụ chiến đấu. Thực hiện nhiệm vụ quốc tế, Trường đã tiếp nhận đào tạo bác sĩ cho nước CHDCND Lào (từ năm 1969) và Vương quốc Campuchia (từ năm 1982). Trong từng thời kỳ, từng giai đoạn, lãnh đạo Nhà trường luôn chủ động, sáng tạo đưa ra các giải pháp hợp lý, hiệu quả để ổn định và phát triển Nhà trường.
       Công tác đào tạo phát triển trên nhiều phương diện; từ đào tạo đơn ngành, đến nay Nhà trường đã mở rộng với 07 mã ngành đào tạo bậc đại học: Y khoa, Y học cổ truyền, Y học dự phòng, Y tế công cộng, Dược, Điều dưỡng, Kỹ thuật xét nghiệm y học. Đào tạo sau đại học từ Chuyên khoa I, Chuyên khoa II, đến Bác sĩ nội trú, Thạc sĩ, Tiến sĩ với nhiều mã ngành... Hằng năm, Nhà trường tuyển sinh từ 1.200 đến 1.500 sinh viên, học viên, quy mô đào tạo duy trì từ 6.500 - 7.000. Đến nay, Trường đã đào tạo hơn 3.000 học viên sau đại học, trên 30 nghìn bác sĩ, dược sĩ, cử nhân, trong đó có nhiều bác sĩ của nước CHDCND Lào và Vương quốc Campuchia; năm 2022 có thêm 02 lưu học sinh Mô dăm bich tốt nghiệp.
       Đội ngũ cán bộ không ngừng phát triển cả về số lượng và chất lượng, với tổng số gần 700 cán bộ, viên chức, người lao động. Số giảng viên có trình độ sau đại học đạt trên 90%, số tiến sĩ, phó giáo sư, giảng viên cao cấp… ngày một tăng.
       Nhà trường đã được Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục - Hiệp hội các trường Đại học cao đẳng Việt Nam công nhận đạt chất lượng 02 chương trình đào tạo: Ngành Điều dưỡng trình độ đại học và ngành Y tế công cộng trình độ thạc sĩ. Trường đang tiếp tục triển khai tự đánh giá 03 chương trình đào tạo: ngành Y học cổ truyền trình độ đại học, Dinh dưỡng và Y học dự phòng trình độ thạc sĩ; đồng thời triển khai tự đánh giá trường lần 2 theo chu kỳ kiểm định và thực hiện nâng cao hiệu quả hoạt động hệ thống đảm bảo chất lượng của Trường.
       Hoạt động nghiên cứu khoa học phát triển gắn liền với các dịch vụ, sản phẩm hữu ích, thiết thực cung cấp cho cộng đồng. Trường có quan hệ hợp tác với nhiều trường đại học, các tổ chức, các cơ sở nghiên cứu, đối tác quốc tế trên nhiều nước: Hoa Kỳ, Trung Quốc, Nhật Bản, Hàn Quốc, Đan Mạch, Pháp…
       Cơ sở vật chất, trang thiết bị luôn được lãnh đạo Nhà trường chú trọng, quan tâm nhằm đáp ứng yêu cầu đổi mới, nâng cao chất lượng đào tạo, nghiên cứu khoa học và chăm sóc sức khỏe nhân dân. Nhà trường đã hoàn thành xây dựng cải tạo, chỉnh trang khuôn viên sân trường tạo diện mạo cảnh quan mới khang trang, sạch, đẹp, văn minh. Trong hệ thống cảnh quan sân vườn của Trường có điểm nhấn thứ 2 sau đài phun nước là khuôn viên tượng Hippocrates. Nhà trường cũng đã hoàn thành cải tạo, sửa chữa khu nhà 4 tầng thành Trung tâm Mô phỏng và Huấn luyện kỹ năng với 19 phòng học, thực hành, 07 phòng thi, 03 phòng kho, 04 phòng làm việc, phòng họp với các trang thiết bị cần thiết đáp ứng yêu cầu giảng dạy, học tập các kỹ năng tiền lâm sàng cho sinh viên...
       Ghi nhận sự trưởng thành và lớn mạnh trong hơn 50 năm qua, năm 2015 Nhà trường đã vinh dự được Thủ tướng Chính phủ trao tặng Danh hiệu Anh hùng Lao động. Trường đã vinh dự nhận nhiều phần thưởng cao quý: 03 Huân chương Độc lập (Hạng Nhất, Nhì, Ba); 04 Huân chương Lao động (Hạng Nhất, Nhì, Ba); 01 Huân chương Chiến công hạng Ba; Huân chương Lao động hạng Nhất và Huân chương Tự do của nước CHDCND Lào; Huân chương Vàng xây dựng đất nước và Huân chương Hữu nghị của Vương quốc Campuchia; cùng nhiều Bằng khen, Cờ thi đua... của các cập bộ, ngành trung ương, các địa phương.
       Công sức và cả xương máu của biết bao thế hệ cán bộ, sinh viên, học viên qua 54 năm qua đã tạo dựng lên tầm vóc, vị thế cùng những giá trị nền tảng của mái trường Đại học Y Dược Thái Bình hôm nay. Kỷ niệm 54 năm ngày thành lập Trường (23/7/1968 - 23/7/2022), các thế hệ thầy trò hôm nay càng ý thức sâu sắc trách nhiệm to lớn trong việc giữ vững và phát huy truyền thống vẻ vang, đoàn kết, nỗ lực phấn đấu hoàn thành mọi nhiệm vụ mà Đảng và Nhà nước giao phó; quyết tâm xây dựng Nhà cái Ee88 ngày càng phát triển, hội nhập.